في ظل القيادة الحكيمة لصاحب السمو الشيخ خليفة بن زايد آل نهيان، ‏رئيس دولة ‏الإمارات العربية المتحدة، بُني مستشفى الشيخ خليفة فى رأس الخيمة ويتوسّط ‏المستشفى خمساً من إمارات الدولة هي ‏الشارقة وعجمان وام القيوين ورأس الخمية ‏والفجيرة، و يلبّي بخدماته ‏إحتياجات القاطنين في هذه المنطقة، كما يُعتبر مستشفى ‏الشيخ ‏خليفة التخصّصى أول منشأة طبية رائدة ومركزا للتحويل ‏في ‏الإمارات الشمالية.‏

واعتمادا على رؤية صاحب السمو الشيخ خليفة بن زايد آل نهيان سيقدم مستشفى الشيخ خليفة التخصصى خدمات الرعاية الصحية التخصصية على أسس ومعايير عالمية في الإمارات الشمالية مع التركيز على الأعصاب والأورام وأمراض القلب.

وتبلغ مساحة المستشفى 65,000 متر مربع، يتكون المبنى الرئيسي من ستة طوابق وتتم إدارة المستشفى حالياً من قبل مستشفى جامعة سيول الوطنية.

يمتلك مستشفى الشيخ خليفة التخصصى قدرة استيعابية قدرها 248 سريراً لرعاية المرضى الداخليين بالإضافة إلى عدد من العيادات الخارجية المفتوحة خلال الأسبوع.

كما أن خدمة الزائرين الذين يعانون من أمراض وإصابات طفيفة مفتوحة حالياً للجمهور ومن المتوقع أن يتم إفتتاح قسم الطوارئ إعتبارا من أغسطس 2015.

يوجد في مستشفى الشيخ خليفة التخصصى خمسة أجنحة عامة جناحين للذكور وجناحين للإناث وجناح لكبار الشخصيات هذا بالإضافة إلى أجنحة اضافية تحتوى على إثنين من وحدة العناية المركزة واحدة للقلب بسعة 10 أسرة واخرى طبية بسعة 10 أسرة.

يحتوى كل جناح على غرف خاصة و غرف مشتركة وغرفة للعزل. وقد تم تجهيز غرفة كل مريض بسرير وزر استدعاء الممرضات و تلفزيون و ثلاجة و طاولة السرير وأريكة وجهاز رفع المريض وخزانة وحمام منفصل. بالإضافة إلى ذلك تتوفر خدمة الترجمة على مدار الساعة.

تم تصميم مسارح العمليات العشرة تصميماً متطوراً فضلا عن 49 سريرا متوفر لوحدة الإنتعاش بعد العملية الجراحية. غرفة بها جهاز الرنين المغناطيسي ليسمح بإجراء العمليات جراحية المتطورة التي يتعين القيام بها وكذلك المساعدات لإجراءات خاصة في علاج الأورام بالإشعاع. كما ان هناك أيضا مسرح لعمليات المَعالَجَةٌ الكَثَبِيَّة مجهزه بجدران للحماية من الإشعاع إضافة إلى غرفة تحكم والتي يمكن إستخدامها في جناح الهجين.

وتتم إدراة المستشفى حاليا من قبل مستشفى جامعة سيؤول الوطنية.